2.5 绵羊PTGER3基因编码产物结构功能预测与分析
结构域是二级蛋白序列片段经过盘曲折叠形成的超二级结构，不同的结构域具有不同的特定的功能作用。通过分析PTGER3编码产物的结构域的特点可有效预测基因PTGER3编码产物的功能。从表2可得知，PTGER3主要具有调控功能、辅助因子生物合成、能量代谢和代谢中间产物的功能，可能性分别为0.530、0.133、0.087和0.046，由此推断PTGER3作为运载体在信号传导、能量调控和分泌蛋白转录和翻译中发挥重要调节作用。
2.6 绵羊PTGER3基因编码产物信号肽预测与分析
信号肽序列是存在于分泌蛋白基因编码序列中，在起始密码子之后的一段富含疏水氨基酸多肽的序列。通过检测绵羊PTGER3基因编码产物信号肽的存在情况，可以得知编码产物是否是分泌蛋白和跨膜蛋白以及跨膜蛋白的基本信息。由图5可知，绵羊PTGER3蛋白氨基酸C值为1，Y值为1，S值为1。表明PTGER3基因的编码产物不存在信号肽，是非分泌性蛋白；未发现跨膜区，该蛋白是非跨膜蛋白。
2.7 绵羊PTGER3基因编码产物二级结构的预测与分析
Jpred是一款利用已知氨基酸序列推测其蛋白二级结构的网络服务系统。通过预测绵羊PTGER3基因产物的二级结构，分析后结果如图6所示。绵羊PTGER3基因编码产物从N端的第50个氨基酸才开始出现二级结构，即第50位的丝氨酸处形成第一个α螺旋结构。PTGER3蛋白二级结构按照αααααββαααααααα顺序排列，其中共由13个α螺旋、2个β折叠。
3 讨论
本试验选取登记在NBCI数据库中猪、马、牛、山羊和绵羊等物种的PTGER3基因序列，利用生物信息学方法对绵羊PTGER3基因分析其编码蛋白结构和功能。生物信息学是利用数学方法处理和分析生物数据，基于人们现有对分子生物学的认识和构建生物模型，进而分析其生物学特性的方法。如根据不同核糖核苷酸序列估计其氨基酸组成、蛋白的结构和功能等。利用基因数据库和生物信息学方法系统分析相关基因及其编码产物，是当前功能基因组学的重要研究手段。其明显优于过去的单一基因研究模式，可以在基因组、分子的水平对基因的表达调控网络机制进行系统全面的分析[6]。
4 结论
①研究结果显示，在系统发育树中，绵羊、牛和山羊的PTGER3基因的同源性高于其他物种。
②通過分析绵羊的PTGER3基因序列编码产物的氨基酸的组成，得知分子量为45 568.48 Da，其等电点为9.46，是碱性蛋白质。
③预测显示编码产物是非酶非跨膜非分泌蛋白质，并根据组成的各类氨基酸分子理化性质和比例关系，推测该编码产物是分布于细胞膜表面，通过调控离子通道达到调节生理功能的作用。
④通过对其氨基酸序列的结构域的特点，预测在生物体中该蛋白的生理功能是主要参与细胞中辅酶因子的生物合成、中间产物的代谢和能量代谢。
[1]李劼若，邓思远，侯辉歌，等.前列腺素E2调控骨髓间充质干细胞成骨分化最佳浓度及其效应基因[J].中国组织工程研究，2014（14）：2147-2152.
[2]张迪.PTGER3基因多态性与精神分裂症的关联性研究[D].长春：吉林大学，2009.
[3]赵荷雅.前列腺素受体EP3的结构与功能研究[D].长春：吉林大学，2013.
[4]赵玉华.G蛋白偶联受体的研究进展[J].国外医学（分子生物学分册），2002（5）：302-305.
[5]侯永丰，李通化.HMM用于G蛋白偶联受体超家族的识别[J].同济大学学报（自然科学版），2004（12）：1696-1700.
[6]滕玉鸥，宋彬彬，郭茜楠，等.前列腺素E-2受体EP-3及其调节剂的研究进展[J].天津科技大学学报，2014（1）：1-6.
