一、地方院校转型及专业教学改革需要遵循的原则
1.相应的学科应该与学校转型相适应
在进行学院转型和专业教学改革的过程中，需要遵循重要原则是相应的学科与学校转型相适应，首先各个专业教学的改革要与学校转型的程度相一致，只有这样具体的专业调整才能够和学校相适应，有效地借助于院校的优势进行专业教学的改革。另外，学科的发展和改革离不开学校转型的帮助，只有遵循学校转型的规划和方向，才可以实现有效的学科规划。总而言之，两方面都是息息相关、相辅相成的，只有两者积极配合，才能够实现有效的教学改革和教学实践。
2.学生特点与专业改革相融合
在进行教学转型和教学改革过程中，还要能够实现学生特点和专业改革的融合。因为学生是教学的主体，无论是专业教学还是院校的转型，学生永远是这些活动的中心。如果学生无法适应这些教学的改革，无论改革理念有多么先进，这些改革注定是要失败的。所以，在进行教学改革和教学转型时，必须要实现学生与教学的一致，实现学生能力、学生特点与教学理念、教学改革的相统一，只有如此，才能让后续的工作按照既定的方向和目标进行下去。
二、生物工程专业在教学转型过程中存在的问题
1.学科定位、专业设置不够合理
生物工程专业在教学过程中出现的一个突出问题是学科定位、专业设置不够合理，这阻碍了教学的进步。地方院校生命科学院设置的生物工程专业的课程设置、学生数量、就业状况、存在的问题，课程比例不协调，一般课程和专业课程的比重不够和谐，往往容易造成专业课程稀少，一般课程较多的现象，不利于学生专业能力的提高；学生数量不稳定，每年的招生计划不够稳定，这必然不利于对人才的培养；在就业上，由于学生素质、教学质量、教学体系的`不够完善，使得就业也成为了一大问题。
2.教学理论与实践矛盾突出
在教学中出现的另外一个问题是教学理论与教学实践的严重脱节。教学与实践脱节、教师与实践脱节、课程设置与实践脱节等现象的产生，使教学秩序混乱，理论化过于严重，实践性很差，这必然不利于学生本身的成长。可见，理论和实践的突出矛盾是影响教学改革的突出因素。
3.教师考核方式不灵活阻碍教学转型
教师的考核方式不灵活也阻碍了教学改革及院校的转型。在很多的考核中，考核方式单一模式化，这在很大程度上影响了教师主动性的发挥和创造力的培养，抑制了教师的活力和激情。目前对教师的主要考核方式还停留在对单纯的课堂讲授、教案等纯理论上的考核，在教师职称的评定方面也是唯科研项目和发表论文是好，所谓教学成绩的评定也是纯纸面上的指标。单一的考核方式让很多教师不得不去为了应付相应的“政策”做一些无用功，很少有自己的精力和时间去研究教学，无法和学生展开深入探讨和分析，这对于教学实践和教学改革是相当不利的，只有加速教学改革，深入院校的教学转型，才能够不断地提高教学质量，为国家和社会培养出更多优秀人才。
4.学生的综合能力无法满足教学改革的需要
学生的综合能力无法满足教学改革的需要是一些院校转型过程中面临的重要问题。由于学生是所有教学活动的主要力量，学生的参与是教学活动的根本。学生缺乏能动性和动手能力与创造力等问题严重影响到了教学的改革。如果学生的综合素质无法满足教学改革的条件，那么所有的教学转型和教学改革将不能得到深入开展和实践。我们要清楚地看到，学生缺乏能动性和创造力的根本原因所在，归根结底是我们的教学体系、制度存在不少问题。所谓“一代新人赶旧人”，我们要始终相信学生的潜力是客观存在的，关键是看培养机构有没给他们提供发挥潜能的机会与平台。因此，要想实践生物工程专业教学改革和院校的有机转型，就必须首先提高学生的主观能动性和动手能力，提高他们的潜在素质，提高他们的根本实力，适应教学改革。
三、如何实现地方院校生物工程专业教学的改革及转型
1.学校加强顶层设计，从整体上把握改革方向
实现生物工程专业教学的改革和院校教学转型，首先要站在学校的立场加强顶层设计，从整体上把握教学改革的方向。广泛听取学生、教师、和社会需求的呼声，在管理制度，对教师考核晋级，对学生学习效果的考核方式、培养与就业模式等方面做出制度性的改变。改变传统、落后的教学形式和管理制度，站在人性化的立场进行分析，结合时代的要求和素质教育改革的根本需要来确定改革的方向，科学、理性地把握改革目标，力求实现成功的教育转型。
