四、接受捐赠的资产核算不当，需改变其核算方法
现行事业单位会计制度规定，事业单位接受固定资产捐赠时，根据捐赠者提供的有关单据或按同类固定资产的市场价格及接受捐赠时发生的有关费用确认入账价值，其会计分录为借记“固定资产”科目，贷记“固定基金”科目；接受非限定用途财物捐赠时，入账的计价依据与固定资产相同，不同的是接受捐赠时会计分录为借记“银行存款”或“材料”科目。贷记“其他收入”科目，而其他收入是事业单位的一种收入，年末要将收入结余转入“事业结余”科目，参与事业单位的结余分配。可见，同样是接受捐赠业务，处理方法却存在差异，一个是将接受的捐赠计入净资产，—个却是计入单位收入，而对于事业单位接受限定用途财物捐赠的核算，现行制度又规定得不清晰，如果也将接受限定用途财物捐赠作为其他收入核算，这不仅不符合收入确认的标准，也违背了可比性原则。由此，这种处理方法不够严密，不应将接受捐赠的非限定用途财物作为其他收入进行核算。事业单位在接受未限定用途的其他财物时，实质上是增加了事业单位的净资产，比照企业单位接受的捐赠资产计入所有者权益“资本公积”的方法，建议事业单位接受非限定用途的财物捐赠计入“事业基金”账户，同样，将限定用途的财物捐赠计入“专用基金”账户，以便更好地规范相同会计业务的核算。
五、所得税帐务处理不妥，应调整其核算方法
按照事业单位会计制度规定，事业单位通过经营活动取得的收入，应该在年终计算应交所得税，会计分录为借：结余分配—应交所得税，贷：应交税金—应交所得税，这种情况下，把所得税作为对事业单位收益的一种分配。而在企业会计制度中，所得税是企业为取得收入而发生的一项费用，会计分录为借：所得税，贷：应交税金—应交所得税，这种所得税费用观越来越得到业内人士的认可，也更接近于国际上的处理方式。应该说事业单位交纳所得税也是一种支出而不是对收益的分配，会计处理应该与企业保持一致，即：增设“所得税”科目，年终计算应交所得税时，会计分录同样是借：所得税，贷：应交税金—应交所得税。
六、全面反映财务信息，增加现金流量报表
企业单位会计核算的基础是权责发生制，金流量表作为企业管理部门编制现金预算的依据，已经成为企业的三大会计报表之一，其资产负债表提供事业单位一定时点财务状况，是静态财务信息，收入支出总表反映事业单位一定期间的财务成果，提供结余的构成，是动态信息，二者都不能反映财务状况变动的原因。现金流量表提供一定期间现金流入流出的动态财务信息，表明经营、投资、筹资活动过程中现金的流入量和流出量，说明了资产、负债、净资产的变动原因，是资产负债表和收入支出总表的补充和说明。而事业单位会计核算基础是收付实现制，而没有规定编制现金流量表，随着事业单位将核算基础改为权责发生制，有必要编制现金流量表。通过编制现金流量表，可以动态地反映其未来的现金流量，预测其变化发展趋势，可以评价事业单位投资和理财活动对经营成果和财务状况的影响，有效地防范事业单位财务风险。
一、当前行政事业单位预算会计制度存在的问题
1.收付实现制存在一定的弊端
随着权责发生制被大力提倡，收付实现制的弊端也让大家形成了一定的认识。收付实现制采用以现金的收入与支出为标准，记录收入的实现和费用的发生。在现代社会中，在实际的会计记录中，收付实现制无法准确地反映企业经济活动的全貌，尤其是单位中存在合同跨月份支付费用或资金收入等情况，收付实现制在一定程度上影响会计信息质量。使得单位担负着一定的财务风险。
2.预算会计体系不完善
长期以来，行政事业单位的预算制度主要采取下报上审，再财政拨款的模式。而预算的制定则除了在对未来一定时间的收支做出一定的计划外，还会以以往的预算资金作为参考，这种模式往往使得行政事业单位在预算金额的上报过程中，在以往金额为基础的情况下，尽量提高预算金额。同时，相关监管部门对预算的执行过程缺乏严格的监督，预算的使用结果缺乏科学的分析与评判，最后对下一年度的预算缺乏有效的总结与完善，在不完善的.预算会计体系下，预算资金难以得到合理与高效地使用。
